В настоящее время в Чешской республике существует 300 религиозных общин.

Общины объединены в 5 диоцезов с центрами в Праге, Плзне, Градце Кралове, Брно и Оломоуце.

В Словакии существует лишь одна Братиславская епархия.

Высшим руководством церкви является Центральный совет церкви, возглавляемый Патриархом.