V roce 1410 byl Hus dán do klatby poté, co protestoval proti pálení Viklefových knih na arcibiskupův příkaz. Arcibiskup na Husa žaloval i u nového papeže Jana XXIII. a poté byl Hus obeslán k papežskému soudu – tam se ale nedostavil.
V květnu 1412 přišli s bulou papeže Jana XXIII. do města zmocněnci k prodeji odpustků. Proti tomuto svatokupectví vystoupil Hus 17. června na veřejném celouniverzitním schromáždění.
Papežská klatba nad Husem z 18. října 1412 byla spojena s interdiktem, a tak Václav IV. vyzval Husa k odchodu na venkov. Hus proto v listopadu Prahu opuští.
Na venkově Hus kázal česky prostým lidem a napsal řadu spisů. V roce 1412 vzniká Výklad víry a desatera, v roce 1413 spis O svatokupectví, Dcerka, O šesti bludích a důležitý latinský traktát De ecclesia - O církvi, který shrnul jeho učení.
